Ett antal framstående universitet kan hittas i Uruguay. Universitetet i republiken är den största och mest prestigefyllda högskola ligger i landet, som lockar studenter från hela Sydamerika och i hela världen.

Kraven för att komma in på ett PhD-program inkluderar ofta att studenten redan har en masterexamen. Dessutom måste man ofta skriva en doktorsavhandling som till största del ska bestå av original akademisk forskning. I vissa länder kan man behöva försvara detta arbete inför en opponent och/eller en betygsnämnd.