Internationell doktorsexamen i strukturbiologi

The International Doctorate in Structural Biology är en internationell doktorsexamen i samarbete med universiteten i Frankfurt och Utrecht. Den etablerades med ett avtal som undertecknades av de tre rektorerna 2001. På basis av detta avtal anses doktorandtiteln som studenterna erhåller i slutet av programmet likvärdig med den som erhålls vid Bijvoet Centre for Biomolecular Research och med doktorandtiteln i kemi och biokemi från universitetet i Frankfurt.

Doktorskursen syftar till bildandet av doktorer som ligger i framkant av kunskap och utbildning inom området moderna undersökningsmetoder inom strukturbiologi, bioteknik och systembiologi. Det ger en mängd kunskap till utbildning av experter inom området strukturkemi tillämpad på biologiska makromolekyler i lösning, i fibriller, i membran eller i celler, och inom området molekylärbiologi för uttryck av isotopiskt berikade rekombinanta proteiner.

Värdinstitution

Magnetic Resonance Center (CERM) vid University of Florence är en forskningsinfrastruktur som stöds av Europeiska kommissionen för att tillhandahålla transnationell tillgång till biologisk NMR. CERM är ett av de första laboratorierna i världen för kvalitet på utrustning, produktion och vetenskaplig trovärdighet inom området strukturbiologi och NMR. Infrastrukturen är unikt utrustad med ett stort antal NMR-spektrometrar som sträcker sig från 1200 MHz ner till 0,01 MHz, genom 950, 900, 850 WB, 800, 700, 600, 500 och 400 MHz spektrometrar. Många av dessa instrument är utrustade med en kryosond. Den har en specialiserad tradition inom undersökning av metalloproteiner, särskilt paramagnetiska metalloproteiner. CERM är en kärnmedlem i INSTRUCT, den europeiska infrastrukturen för integrerad strukturbiologi, som inkluderar center för spjutspetsteknologi, vetenskaplig expertis och utbildning.

Eleverna tränas i gränssnittet mellan biologi och oorganisk kemi genom bioberäkning och spektroskopi. Det långsiktiga utbildningsmålet är att skapa forskare som är kapabla att rama in specifika problem i ett allmänt sammanhang, att betrakta multidisciplinaritet som ett primärt behov och att betrakta transnationellt samarbete som ett krav för att utveckla en sammanhängande generation av europeiska forskare.

Ämnen som ligger till grund för kursen är:

• Kärnmagnetisk resonans (i lösning och i fast tillstånd) och röntgenkristallografi för strukturella studier, funktion och dynamik hos biologiska makromolekyler, protein-proteininteraktioner;
• Molekylärbiologi och cellbiologiska tekniker för beredning och manipulation av proteiner, DNA och bakteriekonsortier;
• utveckling av nya läkemedel genom läkemedelsdesigntekniker;
• Bioinformatik som en grundläggande strategi för studiet av kinetiska och termodynamiska fenomen och proteindynamik, för att lära och utveckla metoder för användning av genomiska databaser för att identifiera molekylära mål för utveckling av nya läkemedel;
• metabolomik.

Doktorandprogrammet bygger på samarbetet mellan forskargrupper från universiteten i Utrecht, Frankfurt, Lyon och Oxford, bland de viktigaste i världen inom området strukturbiologi.

Målet med kursen är att ge en högkvalitativ och multidisciplinär forskarutbildning inom området strukturbiologi. För att uppnå detta innehåller kursen ett mycket brett integrerat program som omfattar expertis inom kemi, biologi, biofysik, medicin och informatik, som kan ta itu med de faktiska utmaningarna inom området allt från grundläggande frågor till tillämpningar. En ny generation doktorander kommer att utbildas att betrakta multidisciplinär forskning, transnationellt samarbete och integration av olika tekniker som primära behov för utveckling av utmärkt forskning.

Strukturell biologi är nyckeln till innovation inom bioteknik, livsmedelsteknik och biomedicinska tillämpningar. Det spelar en viktig roll för att förstå terapeutikas verkningssätt och underlättar utformningen av innovativa läkemedel och biologiska läkemedel som verkar på specifika molekylära mål. Från och med att bestämma tredimensionella strukturer av makromolekyler, har strukturbiologin utvecklats till att studera makromolekylernas dynamik och makromolekylära mekanismer, och sätta dem i cellulära sammanhang. Det ger en visualisering på atomnivå av biomolekyler och deras funktionssätt. Läkemedelsföretag har strukturella biologiavdelningar som är involverade i olika stadier av pipelines för läkemedelsupptäckt. Faktum är att områden som informerade läkemedel och nya vacciner ofta är mycket beroende av strukturella data.

Större och större molekylära system och allt mer komplexa biologiska fenomen förväntas avslöjas i framtiden genom integrativa strukturbiologiska tillvägagångssätt som kombinerar kompletterande experimentella och beräkningsverktyg.

Kandidaterna kommer att utbildas för att

• skaffa en solid gemensam vetenskaplig bakgrund inom området strukturbiologi,
• få en avancerad och fokuserad infrastrukturbaserad utbildning-om-forskning i sin forskningsmetodik
• Delta och främja sin forskning i internationella konferenser
• kommunicera resultaten av sitt arbete i internationella publikationer
• vidga sina vyer genom ett stort utbud av kurser och seminarier
• stimulera tvärvetenskapliga samarbeten
• stimulera rörlighet och transnationella samarbeten
• Skaffa icke-vetenskaplig utbildning för förbättrade karriärperspektiv
• utveckla sig till skickliga, fördomsfria, oberoende unga forskare.